自2010年起，学术出版中心将全面使用《学术不端检测系统》，由此进一步加强对存在抄袭与剽窃、伪造、篡改等学术不端问题稿件的审查力度。
《学术不端检测系统》由中国学术期刊（光盘版）电子杂志社于2008年年底开发完成，它分为《科技期刊学术不端文献检测系统（AMLC）》、《社科期刊学术不端文献检测系统（SMLC）》、《学位论文学术不端行为检测系统（TMLC）》3个子系统。该系统以《中国学术文献网络出版总库》为全文比对数据库，可检测抄袭与剽窃、伪造、篡改、不当署名、一稿多投等学术不端文献。
经过过去1年的小样本试用，学术出版中心已经掌握了《学术不端检测系统》的全部工作特性并积累了大量检测经验，从而会尽可能地保证对稿件评判的准确性。学术出版中心除对新收稿件进行全面检测外，还将对已录用还未发表的稿件进行检测，对已发表的稿件进行抽样检测，对问题稿件，将采取适当措施加以处理。
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